Оценка эффективности 4 наборов ПЦР в реальном времени для диагностики пневмонии Pneumocystis jirovecii

Оценка эффективности 4 наборов ПЦР в реальном времени для диагностики пневмонии Pneumocystis jirovecii

Резюме

Пневмония, вызванная Pneumocystis jirovecii (PCP ) – распространённая инфекция у ВИЧ инфицированных и других людей, имеющих иммунодефицитный статус. Последние несколько лет ПЦР анализ пульмонологических образцов стал неотъемлемой частью лабораторной диагностики. Не смотря на это, очень мало данных о сравнительном анализе доступных методов ПЦР диагностики. 

В этой работе, на 148 пульмонологических образцах мы оценили соответствие четырех методов выявления Pneumocystis jirovecii с помощью ПЦР в реальном времени, трех коммерческих наборов: AmpliSens®, MycAssay®, BioEvolution® и одного ПЦР набора “in-house” (Fillaux 2008). Результаты показали диапазон конкордантности от 81.6% до 96.6% (kappa 0.64 – 0.93). Наилучшее соответствие было между тремя методами: “in-house”, AmpliSens® и MycAssay® (kappa > 0.8). 

Представленные методы также были оценены согласно классификации вероятности PCP (доказанный, предполагаемый, возможный или не окончательный диагноз PCP) основанный на клинических, рентгенологических признаках, а также на прямой оценке бронхоальвеолярного лаважа. 

В категории “доказанный PCP”, ДНК Pneumocystis jirovecii была выявлена всеми четырьмя методами. В категории “предполагаемый PCP” , положительный ПЦР для всех образцов был получен наборами “in-house”, AmpliSens® и MycAssay® , тогда как набор BioEvolution® не выявил ДНК Pneumocystis jirovecii в двух образцах. В категории “возможный PCP” процент положительных ПЦР образцов варьировал от 54.5% до 86.4%. Выявление носительства у пациентов обсуждается.

В заключение, среди четырех оцененных ПЦР методов, один не позволяет выявлять пациентов носителей Pneumocystis jirovecii, но показал хорошие результаты в группах “доказанный PCP” и “предполагаемый PCP”. Три другие метода показали отличные результаты во всех группах и позволяют выявлять очень низкую концентрацию Pneumocystis jirovecii.